以“食物链”原理为依据发展起来的良性循环多级利用型模式。生物之间相互依存又相互制约，一个生态系统中往往同时并存着多种生物，它通过一条条食物链密切地联系在一起。如按照食物链的构成和维系规律，合理组织生产，就能最大限度地发挥资源潜力，节省资源且减少环境污染。如利用作物秸秆作饲料养猪，猪粪养蛆，蛆喂鸡，鸡粪施于作物，在这种循环中，废弃物被合理利用，可减少环境污染。利用食物链组织生产的还有作物—畜牧—沼气循环；作物—食用菌循环等。利用生态系统中生物间相互制约，即一个物种对另一物种相克或捕食的天敌关系，还可人为地调节生物种群，达到降低害虫、杂草及病菌对作物危害的作用，如利用赤眼蜂对付玉米螟，杀螟杆菌防治稻纵卷叶螟等。
　 根据生物群落演替原理发展起来的时空演替合理配置型模式。根据生物群落生长的时空特点和演替规律，合理配置农业资源，组织农业生产，是生态农业重要内容之一。采用这种模式，可充分利用农业资源，使产业结构趋向合理，并保护好农业生态环境。例如，为了让农副业生产向空间或地下多层次发展，可在田间实行高秆、矮秆作物搭配种植，同时在田间的沟、渠、过道的空间搭设棚架，栽种葡萄、云豆等爬蔓作物；可在温室、蔬菜大棚、专业化生产工厂里，采用普通栽培、无土栽培等方法，进行多层次生产；还可将种植植物和动物养殖搭配起来等。在时间演替上，可采用间作方式，在同一土地上种植成熟期不同的作物，以充分利用资源。
　 在生态经济学原理指导下的系统调节控制型模式。在一个生态系统中，生物为了繁衍生息，必须随时随地从环境中摄取物质和能量，同时环境在生物生命活动过程中也得到某些补给，以恢复元气和活力。环境影响生物，生物也影响环境，受到生物影响而改变了的环境又对生物产生出新的影响。如果不顾这个规律，过度开发，只顾索取，不给回报，便会使环境质量下降，资源枯竭。所以生态农业必须通过合理耕作、种养结合来调节控制生态系统，实现良性循环和可持续发展。如合理使用化肥、农药，有机和无机相结合，资源利用和保护相结合，促进生态和经济两方面的良性循环。

农业标准化
　 农业标准化是由标准化概念按行业分类衍生而来的。因此，要准确表达这一概念，首先要理解标准化的概念。标准化学科包括两个最基本的概念，即标准和标准化。
　标准：为在一定的范围内获得最佳秩序，对活动或其结果规定共同的和重复使用的规则、导则或特性的文件，称为标准。该文件经协商一致制订并经一个公认机构的批准。标准应以科学、技术和经验的综合成果为基础，以促进最佳社会效益为目的。
　 标准化：为在一定的范围内获得最佳秩序，对实际的或潜在的问题制订共同的重复则的活动，称为标准化。它包括制订、发布及实施标准的过程。
　 以农业为对象的标准化活动称为农业标准化。